В организованном им Кожуховском походе отрабатывались взаимодействия между различными типами войск. Была возведена тренировочная крепость на 5000 гарнизонных, а общее количество участников этих первых официальных учениях русского царства по разным оценкам было от 15 до 40 тысяч человек.
Очевидная отсталость организации армии и качества её оснащения — отсутствие военной школы для специализированных офицеров, устаревшее вооружение и отсутствие единых стандартов оснащения войск.
Особенно ярко это выразилось в первом Азовском походе и первой неудачной осаде Нарвы — войска были плохо организованы, уступали в качестве вооружения (ружьями были старые пищали, а русский порох оказался по качеству хуже европейского), а главное — не было достаточного количества квалифицированных офицеров. Приглашенные саксонские офицеры и генералы не пользовались доверием солдат.
Пётр I стремился получить доступ к морю и построить флот — без регулярно восполняемых и современно вооруженных военных сил эта задача была невыполнимой.
Наличие регулярного военно-морского флота не только гарантировало бы дополнительные преимущества во время военных операций, но и гарантировало относительную безопасность торговых судов.
Кроме прочего, Пётр I отличался аналитическим складом ума, быстро оценивал недостатки нововведений, корректировал работу создаваемых учреждений и предприятий. Известны случаи, когда за поставку некачественного вооружения или снаряжения, управляющие фабриками и снабжением подвергались серьезным наказаниям, вплоть до смертной казни.
Нельзя также не учесть в качестве причины участие московских стрельцов в бунтах 1682 и 1698 годов.